Shopee Cup™ akan berangsung dalam format liga dengan babak play-off kualifikasi dan babak penyisihan grup. Shopee Cup akan siap bergulir mulai 17 Juli 2024 dan berlangsung hingga 21 Mei 2025.
Tim yang bertanding dalam Shopee Cup™ 2024/2025 harus sebelumnya memenangkan Liga Nasional atau menjadi runner-up.Dari Indonesia, Malaysia, Thailand dan Vietnam masing-masing akan mengirimkan dua tim.
Sedangkan dari Filipina dan Singapura akan mengirim satu tim. Sedangkan, juara Liga Nasional dari Brunei, Kamboja, Laos dan Myanmar akan bersaing lagi untuk memperebutkan dua jatah di babak grup melalui babak play-off kualifikasi.
Selanjutnya, 12 klub akan dibagi ke dalam dua grup untuk bermain dengan sistem tandang dan kandang (home and away). Dua tim teratas dari tiap grup lolos ke babak semifinal yang juga akan dipertandingkan menggunakan sistem kandang dan tandang.
Informasi mengenai format kompetisi, jadwal, hingga klub peserta Shopee Cup™ 2024/2025 akan diumumkan saat pengundian resmi yang berlangsung pada pekan pertama Mei.